Balconi est fondée en 1953 à Nerviano près de Milan lorsque le pâtissier Michele Balconi ouvre une boutique artisanale spécialisée dans les gâteaux à base de pain d’épice moelleux. En 2008, elle figure parmi les six premières entreprises du secteur italien de la confiserie avec un chiffre d’affaires de 150 millions. En 2011, le fonds Clessidra acquiert 80% des actions en apportant du capital pour la croissance par acquisitions. En 2013 arrive Biscottificio Baroni pour les gaufres et les biscuits, en 2017 Valdenza pour les pâtes fraiches, en 2023 IDP Pattini pour les muffins et les gâteaux. En 2024, des levures naturelles avec des levures mères sont introduites depuis 1896. En 2025, les acquisitions de Pasticceria Freddi e Melegatti créent un des plus importants pôles de confiserie d’Italie.